1、什么是税务核查
税务核查是由税务部门具体承担的，主要针对高新技术企业产品（服务）收入、研发费用占比、科技人员占比三项指标以及企业所得税征收方式等的核查。2、税务核查前的准备
接到核查通知后请认真准备，问清核查重点，一般情况下需要准备以下资料：1.高企申报材料2.营业执照原件3.知识产权证书4.近三年的研发费用辅助账或账套内的研发费用明细账5.近一年的高新产品收入辅助账6.近三年的年度审计报告7.近三年的研发费用专项审计报告和近一年的高新产品收入专项审计报告8.近三年的记账凭证9.近一年的全员花名册和科技人员名单10.科研项目立项报告和其他证明材料11.近一年的销售合同、用户反馈报告12.与研发相关的各项制度文件13.其他资质文件确保与研发相关的技术、财务、人事、项目等负责人在场。税务核查是高企认定流程的重要环节，税务人员有一票否决权，企业人员要积极配合，对于税务人员提出的问题要做出合理的解释。3、指标核查主要内容
（一）企业所属国民经济行业是否为不适用研究开发费用税前加计扣除政策的行业。不适用税前加计扣除政策的行业：1.烟草制造业；2.住宿和餐饮业；3.批发和零售业；4.房地产业；5.租赁和商务服务业；6.娱乐业；7.财政部和国家税务总局规定的其他行业。上述行业以《国民经济行业分类与代码（GB/-）》为准，并随之更新。（二）企业所得税征收方式是否存在核定征收情况。（三）企业从事研发和相关技术创新活动的科技人员占企业当年职工总数的比例是否不低于10%。（四）企业近三个会计年度（实际经营期不满三年的按实际经营时间计算，下同）的研究开发费用总额占同期销售收入（按企业所得税年度纳税申报表的口径计算的主营业务收入和其他业务收入之和）总额的比例是否符合以下要求：1.最近一年销售收入小于万元（含）的，比例不低于5%；2.最近一年销售收入在万元至2亿元（含）的，比例不低于4%；3.最近一年销售收入在2亿元以上的，比例不低于3%。其中，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于60%。（五）企业近一年高新技术产品（服务）收入占企业同期总收入（收入总额减去不征税收入）的比例是否不低于60%。（六）资格期满当年重新申请认定的企业申请认定当年与申请认定前一年，享受高新技术企业与研究开发费用加计扣除优惠政策情况。
4、数据比对内容
（包括但不限于以下六个方面）（一）企业所属行业比对查看企业认定申请材料中《企业注册登记表》“所属行业”是否与征管系统数据一致。（二）企业所得税征收方式比对查看企业近三个会计年度征收方式，企业认定申请材料中《企业注册登记表》“企业所得税征收方式”是否与征管系统数据一致，如不一致，应当以征管系统数据为准。（三）高新技术产品（服务）收入占比比对1．高新技术产品（服务）收入数据比对查看《高新技术企业认定申请书》“主要情况表-近一年高新技术产品（服务）收入”栏数据，与分产品（服务）填写的“上年度高新技术产品（服务）情况表-上年度销售收入”栏各表合计金额、“高新技术产品（服务）收入专项审计报告”中确认的高新技术产品（服务）收入数据比对。资格有效期满重新认定的，还要与征管系统中企业所得税年度申报表A《高新技术企业优惠情况及明细表》中的“本年高新技术产品（服务）收入”行次数据比对。2．总收入数据比对查看《高新技术企业认定申请书》“主要情况表-近一年企业总收入”栏填写金额，与征管系统企业所得税年度申报表计算数据比对。3、高新技术产品（服务）收入归集的前提，对应的产品必须是由企业相关知识产权的技术应用生产而获得的，所以要说明知识产权与产品的关联性。（四）企业科技人员占比比对查看《高新技术企业认定申请书》“人力资源情况表”内“企业职工”“科技人员”栏对应“总数（人）”行次数据，与征管系统中企业所得税年度申报表A《企业所得税年度纳税申报基础信息表》中“从业人数”行次数据参照比对。资格有效期满重新认定的，还要与A《高新技术企业优惠情况及明细表》中的“本年科技人员数”“本年职工总数”行次数据比对。企业须提供申请认定时在职职工人员证明材料，如工资证明，社保证明，劳动合同等以及科技人员考勤表，工时分配表等。需要注意高新技术企业资格认定与企业所得税年报二者在统计职工人数方面的口径差异：前者按照月平均值计算，后者按季度平均值计算。（五）研究开发费用占比比对1.研究开发费用数据比对1）研发费用是否设置研发支出专账或辅助账，核算研发项目的各支出明细科目费用，并以此作为依据进行核查；2）是否制定研发费用分摊依据，准确归集各项目的研发费用：①人员人工费②直接投入费用③折旧费用和长期待摊费用④无形资产摊销⑤设计费用⑥装备调试费用与试验费用⑦委托外部研究开发费用⑧其他费用2.销售收入数据比对（六）高新技术企业资格期满当年重新申请认定的企业，已享受优惠情况比对查看企业申请认定当年与申请认定前一年，高新技术企业低税率优惠与研发费用加计扣除优惠政策享受情况。